Китайські дослідники зібрали пангеном водяного кальтропу для подальшої селекції та введення їстівного дикуна до переліку сільгоспкультур.
Рис, кукурудза та пшениця забезпечують більше половини калорій, що споживаються людиною. Скорочення різноманітності сільськогосподарських культур є значним ризиком для глобальної продовольчої безпеки. Таким чином, використання так званих безгоспних дикорослих культур стало ефективним підходом до вирішення криз продовольчої безпеки. timenews.net.ua
Тим не менш, в умовах швидкої модернізації міст та села та інтенсифікації методів ведення сільського господарства, доступність дикоросів скорочується, при цьому спостерігається надмірний збір та втрата ресурсів для можливої селекції.
Водяний кальтроп ( Trapa spp. ) – Типовий дикорос, який свідомо збирали і відносно одомашнили ще в період неоліту. За часів китайських династій Тан та Сун і далі після штучної селекції було виведено понад 20 сортів, наприклад «Улін», «Наньхулін».
З розвитком геномних технологій дослідження пангеном стало важливим підходом для всебічного розуміння механізмів, що лежать в основі агрономічних ознак. Водяний кальтроп має багато народних назв від водяного каштана до диявольського стручка чи буйволиного горіха. Це прісноводний однолітник, який виробляє запилювані плоди з дуже великим крохмалистим і їстівним насінням.
У жовтні 2023 року в журналі Horticultural Research дослідницькою групою доктора Інсюн Цю з Уханьського ботанічного саду Китайської академії наук була опублікована дослідницька стаття під назвою «Панген водяного кальтропу виявляє структурні варіації та асиметричну дивергенцію субгеномів після алополі».
У цьому дослідженні автори створили дві збірки геному на рівні хромосом двох диплоїдних видів T. natans і T. incisa . У поєднанні з чотирма раніше опублікованими (суб)геном Trapa був створений пангеном на основі генів.
Пангеном Trapa надає платформу для ретельного вивчення геномних варіацій видів, тим самим сприяючи кращому розумінню еволюційної та функціональної геноміки цього в даний час недостатньо використовуваного різновиду сільськогосподарської культури. Загалом дослідження проливає світло на архітектуру геному та еволюцію водяного кальтропу, а також полегшує функціональні геномні дослідження та програму розведення.
